U rukovođenju stručnim radom Instituta „Torlak“, savetodavnu funkciju i pomoć direktoru pružaju sledeći stručni organi Instituta:
- Stručni savet kao savetodavno telo direktora i Upravnog odbora Instituta
- Etički odbor, stručno telo koje prati pružanje i sprovođenje zdravtsvene zaštite na načelima profesionalne etike
- Komisija za unapređenje kvaliteta rada, stručno telo koje se stara o unapređenju kvaliteta zdravstvene delatnosti Instituta
- Naučno veće, stručno telo koje predlaže program naučnoistraživačkog rada i koje se obrazuje u skladu sa zakonom kojim se uređuje oblast naučnoistraživačke delatnosti.
